Multiple wheat genomes reveal global variation in modern breeding

Advances in genomics have expedited the improvement of several agriculturally important crops but similar efforts in wheat (Triticum spp.) have been more challenging. This is largely owing to the size and complexity of the wheat genome1, and the lack of genome-assembly data for multiple wheat lines2,3. Here we generated ten chromosome pseudomolecule and five scaffold assemblies of hexaploid wheat to explore the genomic diversity among wheat lines from global breeding programs. Comparative analysis revealed extensive structural rearrangements, introgressions from wild relatives and differences in gene content resulting from complex breeding histories aimed at improving adaptation to diverse environments, grain yield and quality, and resistance to stresses4,5. We provide examples outlining the utility of these genomes, including a detailed multi-genome-derived nucleotide-binding leucine-rich repeat protein repertoire involved in disease resistance and the characterization of Sm16, a gene associated with insect resistance. These genome assemblies will provide a basis for functional gene discovery and breeding to deliver the next generation of modern wheat cultivars.

Dữ liệu và nguồn

Thông tin khác

Miền Giá trị
Nguồn
Phiên bản
Authors
  • Name: Walkowiak, Sean, Type: Corresponding Author,
  • Name: Gao, Liangliang, Type: Tác giả,
  • Name: Monat, Cecile, Type: Tác giả,
  • Name: Haberer, Georg, Type: Tác giả,
  • Name: Kassa, Mulualem T., Type: Tác giả,
  • Name: Brinton, Jemima, Type: Tác giả,
  • Name: Ramirez-Gonzalez, Ricardo H., Type: Tác giả,
  • Name: Kolodziej, Markus C., Type: Tác giả,
  • Name: Delorean, Emily, Type: Tác giả,
  • Name: Thambugala, Dinushika, Type: Tác giả,
  • Name: Klymiuk, Valentyna, Type: Tác giả,
  • Name: Byrns, Brook, Type: Tác giả,
  • Name: Gundlach, Heidrun, Type: Tác giả,
  • Name: Bandi, Venkat, Type: Tác giả,
  • Name: Siri, Jorge Nunez, Type: Tác giả,
  • Name: Nilsen, Kirby, Type: Tác giả,
  • Name: Aquino, Catharine, Type: Tác giả,
  • Name: Himmelbach, Axel, Type: Tác giả,
  • Name: Copetti, Dario, Type: Tác giả,
  • Name: Ban, Tomohiro, Type: Tác giả,
  • Name: Venturini, Luca, Type: Tác giả,
  • Name: Bevan, Michael, Type: Tác giả,
  • Name: Clavijo, Bernardo, Type: Tác giả,
  • Name: Koo, Dal-Hoe, Type: Tác giả,
  • Name: Ens, Jennifer, Type: Tác giả,
  • Name: Wiebe, Krystalee, Type: Tác giả,
  • Name: N’Diaye, Amidou, Type: Tác giả,
  • Name: Fritz, Allen K., Type: Tác giả,
  • Name: Gutwin, Carl, Type: Tác giả,
  • Name: Fiebig, Anne, Type: Tác giả,
  • Name: Fosker, Christine, Type: Tác giả,
  • Name: Fu, Bin Xiao, Type: Tác giả,
  • Name: Accinelli, Gonzalo Garcia, Type: Tác giả,
  • Name: Gardner, Keith A., Type: Tác giả,
  • Name: Fradgley, Nick, Type: Tác giả,
  • Name: Gutierrez-Gonzalez, Juan, Type: Tác giả,
  • Name: Halstead-Nussloch, Gwyneth, Type: Tác giả,
  • Name: Hatakeyama, Masaomi, Type: Tác giả,
  • Name: Koh, Chu Shin, Type: Tác giả,
  • Name: Deek, Jasline, Type: Tác giả,
  • Name: Costamagna, Alejandro C., Type: Tác giả,
  • Name: Fobert, Pierre, Type: Tác giả,
  • Name: Heavens, Darren, Type: Tác giả,
  • Name: Kanamori, Hiroyuki, Type: Tác giả,
  • Name: Kawaura, Kanako, Type: Tác giả,
  • Name: Kobayashi, Fuminori, Type: Tác giả,
  • Name: Krasileva, Ksenia, Type: Tác giả,
  • Name: Kuo, Tony, Type: Tác giả,
  • Name: McKenzie, Neil, Type: Tác giả,
  • Name: Murata, Kazuki, Type: Tác giả,
  • Name: Nabeka, Yusuke, Type: Tác giả,
  • Name: Paape, Timothy, Type: Tác giả,
  • Name: Padmarasu, Sudharsan, Type: Tác giả,
  • Name: Percival-Alwyn, Lawrence, Type: Tác giả,
  • Name: Kagale, Sateesh, Type: Tác giả,
  • Name: Scholz, Uwe, Type: Tác giả,
  • Name: Sese, Jun, Type: Tác giả,
  • Name: Juliana, Philomin, Type: Tác giả,
  • Name: Singh, Ravi, Type: Tác giả,
  • Name: Shimizu-Inatsugi, Rie, Type: Tác giả,
  • Name: Swarbreck, David, Type: Tác giả,
  • Name: Cockram, James, Type: Tác giả,
  • Name: Budak, Hikmet, Type: Tác giả,
  • Name: Tameshige, Toshiaki, Type: Tác giả,
  • Name: Tanaka, Tsuyoshi, Type: Tác giả,
  • Name: Tsuji, Hiroyuki, Type: Tác giả,
  • Name: Wright, Jonathan, Type: Tác giả,
  • Name: Wu, Jianzhong, Type: Tác giả,
  • Name: Steuernagel, Burkhard, Type: Tác giả,
  • Name: Small, Ian, Type: Tác giả,
  • Name: Cloutier, Sylvie, Type: Tác giả,
  • Name: Keeble-Gagnère, Gabriel, Type: Tác giả,
  • Name: Muehlbauer, Gary, Type: Tác giả,
  • Name: Tibbets, Josquin, Type: Tác giả,
  • Name: Nasuda, Shuhei, Type: Tác giả,
  • Name: Melonek, Joanna, Type: Tác giả,
  • Name: Hucl, Pierre J., Type: Tác giả,
  • Name: Sharpe, Andrew G., Type: Tác giả,
  • Name: Clark, Matthew, Type: Tác giả,
  • Name: Legg, Erik, Type: Tác giả,
  • Name: Bharti, Arvind, Type: Tác giả,
  • Name: Langridge, Peter, Type: Tác giả,
  • Name: Hall, Anthony, Type: Tác giả,
  • Name: Uauy, Cristobal, Type: Tác giả,
  • Name: Mascher, Martin, Type: Tác giả,
  • Name: Krattinger, Simon G., Type: Tác giả,
  • Name: Handa, Hirokazu, Type: Tác giả,
  • Name: Shimizu, Kentaro K., Type: Tác giả,
  • Name: Distelfeld, Assaf, Type: Tác giả,
  • Name: Chalmers, Ken, Type: Tác giả,
  • Name: Keller, Beat, Type: Tác giả,
  • Name: Mayer, Klaus F. X., Type: Tác giả,
  • Name: Poland, Jesse, Type: Tác giả,
  • Name: Stein, Nils, Type: Tác giả,
  • Name: McCartney, Curt A., Type: Tác giả,
  • Name: Spannagl, Manuel, Type: Tác giả,
  • Name: Wicker, Thomas, Type: Tác giả,
  • Name: Pozniak, Curtis J., Type: Tác giả,
Người bảo dưỡng
Email người bảo dưỡng
Article Host Type publisher
Article Is Open Access true
Article License Type cc-by
Article Version Type publishedVersion
Citation Report https://scite.ai/reports/10.1038/s41586-020-2961-x
DFW Organisation JIC
DFW Work Package 3
DOI 10.1038/s41586-020-2961-x
Date Last Updated 2020-11-25T22:40:17.127698
Evidence open (via page says license)
Funder Code(s)
Journal Is Open Access false
Open Access Status hybrid
PDF URL https://www.nature.com/articles/s41586-020-2961-x.pdf
Publisher URL https://doi.org/10.1038/s41586-020-2961-x